O fanático revolucionário Shishio zarpa em seu navio couraçado em sua tentativa de iniciar uma guerra civil no Japão para derrubar o governo do Imperador Meiji, levando Kaoru com ele. Para impedi-lo a tempo, Kenshin treina com seu antigo mestre para aprender a sua técnica definitiva.

Este filme é a conclusão da história do Shishio, iniciada no filme "Samurai X: O Inferno de Kyoto".

A história começa no momento em que Kenshin acorda na casa da pessoa que o resgatou na praia. Essa pessoa é o seu antigo mestre Seijurou Hiko (Maruyama Tomomi), aquele que lhe ensinou a usar o estilo Hiten Mitsurugi.

Dessa forma, conhecemos a vida anterior de Kenshin, contada em flashback. Kenshin pede que seu mestre lhe ensine a técnica suprema da espada, para ele poder enfrentar Shishio e seus homens.

 

 

O mestre acredita que um espadachim deve ser livre de políticas governamentais, e critica seu aprendiz por ele tomar partido no conflito causado pela Restauração Meiji, constantemente chamando-o de "discípulo inútil"! 

Também vemos a busca por uma nova espada, já que durante a luta com Sojiro, no filme anterior, a espada de Kenshin é quebrada.

A um determinado momento, os oficiais do governo, que pediram ajuda para Kenshin lidar com Shishio, resolvem traí-lo e Saito Hajime fica indignado e os questiona: "Onde está o orgulho samurai de vocês?"

A explicação para o nome do filme, que pode induzir o espectador a tirar uma conclusão errônea, vem somente no final, após as batalhas, quando Kenshin e seus amigos estão indo embora.